FCU süsteemide taga olev teadus kasutab füüsika aluspõhimõtteid, eriti termodünaamika seadusi, mis reguleerivad soojusülekandega seotud protsesse, nagu juhtivus ja konvektsioon. Soojus neeldumine toimub selle spiraali kaudu, kui külmutusagens aurustub jahutusrežiimi ajal jahtuma.
Mis puudutab praktilisi tagajärgi, siis FCU-süsteemil on õhu ja külmutusagensi liikumine. Jahutusrežiimis võtab see sellest ruumist soojema õhu ja puhub selle üle spiraali. Seetõttu eemaldab külmutusagens õhust soojust, jahutades seda seega maha.
See jahe õhk tsirkuleeritakse seejärel uuesti ruumi, jahutades seda tõhusalt. Kütterežiimis kasutatakse aga vastupidist protsessi. Soojus eemaldatakse külmutusagensist läbi spiraali ja kantakse õhku, soojendades seda enne selle väljalaskmist tagasi ruumi.